Pein est certainement l'un des personnages les plus mystérieux de Naruto,après Uchiwa Madara. Son véritable nom est Nagato Malgré le faites qu'il possede 6 corps (qui je note sont bizzarrement connu de Jiraiya, avec chacun leur spécialitée, (ressuciter les morts, absorber les justus...)
Déserteur du pays de la pluie. Il semble être le pilier du fuuin jutsu, le rituel d'extraction des bijuus. Afin de sceller le bijuu de Gaara, il use de la technique du Sceau des 9 dragons. Ses connaissances sont donc très poussées, ce qui est confirmé par la technique d'imitation des corps ( les 6 corps) et surtout sa capacité à faire tomber la pluie. Il n'aurait jamais connu la défaite, et c'est à lui que Uchiwa Madara confie la tâche d'éliminer Naruto.
Natif D’Ame no Kuni, Pein est ce que l’on appelle un orphelin de guerre, vivant dans la rue avec deux autres enfants, Yahiko et Konan (qui deviendra par la suite la seule kunoichi de l’Akatsuki). Nagato de son vrai nom, il ne se distinguait pourtant pas de ses camarades pour son courage et sa puissance.
A l’issue de la guerre entre Konoha et Ame, les trois enfants firent la rencontre des Sannins de Konoha (Orochimaru, Tsunade et Jiraiya) et furent recueillis par Jiraiya qui décida de rester avec eux quelques temps, jusqu’à ce qu’ils deviennent autonomes.
Un soir, alors que Yahiko et Nagato étaient seuls dehors, ils furent attaqués par un ninja du pays de la Roche. Durant ce combat, Yahiko fut blessé. Nagato rentra alors dans une sorte de transe meurtrière et massacra le ninja de la Roche. Lorsque Jiraiya arriva sur les lieux du combat il fut surpris de voir les yeux de Nagato : cet enfant possédait le Rinnegan, le plus puissant des 3 grands Doujutsus
Suite à cette découverte, Jiraiya passa 3 ans à entrainer les trois orphelins du village de Ame. Il rentrera à Konoha à l’issue de ces trois années, laissant derrière lui trois puissants ninjas.
Cependant, Nagato ne grandit pas comme Jiraiya l’eut espéré. Il est désormais le second de Tobi et l’un des ninjas les plus puissants et les plus recherchés du monde.
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